L'Aou Senese, con sede al Policlinico Santa Maria alle Scotte, è una realtà ospedaliero-universitaria di rilievo nazionale che svolge attività assistenziali, didattiche e di ricerca in stretta integrazione con l'Università di Siena. La struttura dispone di circa 600 posti letto e di un'organizzazione per Dipartimenti ad Attività Integrata che consente percorsi assistenziali multidisciplinari nei settori cardiotoraco-vascolare, oncologico, emergenza-urgenza, materno-infantile, scienze chirurgiche, scienze mediche, neurologiche e terapie cellulari/ematologia.

La dotazione comprende centri di riferimento regionali, tra cui i centri trapianti (cuore, polmone, rene, cellule staminali emopoietiche), una banca regionale della cute e centri specialistici per patologie complesse e malattie rare. L'offerta diagnostica e terapeutica si integra con laboratori di patologia clinica e traslazionale, medicina nucleare, diagnostica per immagini e percorsi dedicati di chirurgia specialistica, inclusa attività in convenzione per tecniche avanzate.

L'organizzazione aziendale prevede Direzione Generale, Direzione Sanitaria e Direzione Amministrativa, oltre a strutture complesse e dipartimentali che favoriscono la qualità delle cure, la sicurezza dei pazienti e l'innovazione. I servizi di accoglienza, URP e comunicazione garantiscono supporto informativo e orientamento per cittadini e utenti. L'Aou Senese aderisce a protocolli regionali e nazionali, partecipa a programmi di ricerca e formazione e promuove iniziative di trasparenza e partecipazione.